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circRNA测序
环状RNA（circular RNA, circRNA）是一类特殊的非编码RNA分析，测序采用Illumina测序平台进行测序，针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析， 环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。
- 生长发育研究： 分析发育过程或生长过程时空特异性表达的基因集，描述生长图谱；
- 性状或环境差异研究：寻找研究对象重要性状或表型；研究胁迫环境下的机体响应机制；
- 互作关系研究：通过转录水平寻找到关键调节的基因或者代谢通路，研究宿主与寄主之间相互作用关系。
典型宏基因组数据分析流程如下图所示：（可以根据实际项目需要定制专门的分析流程）
使用diamond软件将质控后的高质量测序数据比对到 nr数据库，得到样品的物种组成和相对丰度信息。
在注释时，使用CARD数据库中的工具软件rgi将非冗余基因的蛋白序列分别数据库进行比对，找出比对上的数据库中对应序列，并得到对应的抗性基因和抗性相关信息。
主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)是一种分析和简化数据集的技术，通过将方差进行分解，将多组数据的差异反映在二维坐标图上，坐标轴取能够最大反映方差 的两个特征值。通过分析不同样品物种组成可以反映样品间的差异和距离。PCA图上两个样品距离越近，则表示这两个样品中物种的组成越相似。使用R语言工具分别绘制不同分类水平PCA分析图
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